Pada babak fase grup wilayah, 28 tim nantinya dibagi ke dalam empat grup. Isi tiap grup ada tujuh tim dan mereka bermain kandang – tandang.
Empat tim teratas akan lolos ke babak 16 besar. Mereka akan ditampung dalam dua grup terpisah, yang masing-masing berisi delapan tim.
Dua tim teratas dari masing-masing grup itu berhak melaju ke final four. Empat tim itu akan bertarung masing-masing sekali.
Pemenangnya akan langsung mendapat tiket promosi ke Liga 1. Selain itu mereka berhak bertarung di babak final untuk memperebutkan gelar juara Liga 2.
Sementara yang kalah juga akan bertarung sekali lagi. Mereka memperebutkan tiket promosi ke Liga 1 yang tersisa. Nantinya ada babak 12 besar yang tersaji.
Pesertanya adalah tiga tim terbawah dari empat grup di babak pendahuluan. Mereka dimasukkan dalam dua grup yang masing-masing berisi enam tim.
Mereka akan bermain dengan sistem kandang-tandang. Nantinya tiga tim terbawah dari tiap grup akan langsung terkena hukuman degradasi ke Liga 3.
Untuk kompetisi Liga 2 2023/2024, Tim-tim Liga 2 bisa menggunakan satu pemain asing dengan kewarganegaraan bebas. Sisanya adalah pemain asing asal Asia.
Alasan penggunakan pemain asing itu adalah agar para pemain itu bisa meningkatkan kualitas Liga 2. Selain itu agar tim-tim yang mendapat tiket promosi tak kaget kala nanti bermain di Liga 1. (rdr)
